Ngoài Bùi Quốc Anh, cáo trạng ban hành ngày 10-6 của Viện KSND Tối cao đã truy tố Hoàng Gia Hiệp (trú tại phường Liễu Giai, quận Ba Đình - Hà Nội), nguyên Giám đốc Công ty Cho thuê tài chính công nghiệp tàu thuỷ (Công ty VFC), về tội “Tham ô tài sản”. Đáng chú ý, tháng 8-2012, Hiệp đã bị Tòa phúc thẩm - TAND Tối cao xử phạt 13 năm tù về tội Cố ý làm trái quy định của nhà nước về quản lý kinh tế gây hậu quả nghiêm trọng”. Trong vụ án này, Hiệp cùng 8 đồng phạm khác bị xác định đã gây thất thoát hơn 910 tỷ đồng tại Tập đoàn Vinashin.
3 bị can tiếp theo bị truy tố về tội “Lợi dụng chức vụ” quyền hạn thi hành công vụ gồm Đỗ Thị Bích Thuỷ (trú tại quận Hoàng Mai, Hà Nội), nguyên Phó TGĐ Công ty Vận tải Biển Đông; Ngô Văn Nhuận (trú tại quận Thanh Xuân, Hà Nội), nguyên Phó kiểm toán trưởng Kiểm toán Nhà nước khu vực 7; và Nguyễn Thị Lệ Thuỷ (trú tại quận Hai Bà Trưng, Hà Nội), nguyên thủ quỹ Công ty Vận tải Biển Đông.
Thực hiện chủ trương cho phép Công ty Biển Đông được mua một số tàu nhằm mở rộng khai thác và nâng cao năng lực cạnh tranh, tháng 10-2006, số bị can trên đã lợi dụng chức vụ quyền hạn trong Công ty VFC ký hợp đồng, lập khống hợp đồng cho thuê Công ty TNHH Tân Minh Nguyệt làm thầu phụ; ký khống 4 hợp đồng dự án mua tàu cũ với Công ty TNHH Tân Minh Nguyệt để hợp thức hồ sơ thanh quyết toán nhằm rút tiền tham ô. Hành vi phạm tội của các bị can đã gây thiệt hại cho Công ty Biển Đông hơn 4,7 tỷ đồng, qua đó hưởng lợi bất chính hơn 1,4 tỷ đồng.
