Một bị can bị truy tố về tội danh nêu trên trong vụ án này là Nguyễn Đức Hùng (SN 1980), chuyên hành nghề môi giới tàu biển. Vụ việc bắt nguồn từ chuyên án phục kích của Cục Cảnh sát Phòng chống tội phạm môi trường - Bộ Công an, phát hiện kiểm tra tàu Phú Hưng 3 đang neo đậu tại cảng Quy Nhơn (Bình Định). Thời điểm kiểm tra, trên tàu có gần 3.000 tấn quặng Titan. Đại diện chủ tàu không xuất trình được giấy tờ hợp pháp của số Titan trên. Trước dấu hiệu bất thường của số hàng này, vụ việc được chuyển đến CQĐT Bộ Công an để xác minh, điều tra.
Quá trình điều tra, cơ quan công an xác định được sự liên quan của Lê Văn Chiến đối với số Titan nghi vấn trên tàu Phú Hưng 3. Chiến từng công tác tại Chi cục Hải quan Bình Định, sau đó chuyển ngành, về mở Công ty TNHH Đầu tư & xuất nhập khẩu Trung Việt (trụ sở tại TP Quy Nhơn, tỉnh Bình Định). Trung tuần tháng 5- 2011, CQĐT đã ra quyết định khởi tố bị can và lệnh bắt tạm giam 4 tháng đối với Lê Văn Chiến về hành vi buôn lậu. Một thời gian ngắn sau đó, CQĐT làm rõ và khởi tố, tạm giam đồng phạm của Chiến là Nguyễn Đức Hùng, trú tại phường Hải Cảng, TP Quy Nhơn, tỉnh Bình Định. Bị can Hùng được xác định trực tiếp thuê vận chuyển, thanh toán tiền vận chuyển toàn bộ số quặng theo chỉ đạo của Lê Văn Chiến.
Sau gần 1 năm tổ chức điều tra, truy xét, CQĐT đã kết thúc điều tra vụ án, làm rõ hành vi phạm tội của cựu cán bộ hải quan Lê Văn Chiến và đồng phạm như sau. Trong khoảng thời gian từ đầu năm 2010 đến tháng 10-2010, Lê Văn Chiến đã đứng ra thu mua và vận chuyển 29 chuyến tàu chở quặng Titan qua cảng Quy Nhơn và cảng Thị Nại, đăng ký hành trình đến cảng Hải Phòng, Quảng Ninh. Tuy nhiên sau đó, số Titan của các chuyến tàu trên đã bị xuất lậu sang Trung Quốc.
Để thực hiện hành vi phạm tội, Lê Văn Chiến đã thuê Công ty TNHH một thành viên Thương mại và dịch vụ Đồng Tâm ký hợp đồng mua bán hơn 23.000 tấn quặng Titan; thuê Công ty TNHH Hải An mua hơn 52.000 nghìn tấn Titan của một số doanh nghiệp trong nước, rồi làm thủ tục vận chuyển nội địa từ Quy Nhơn đi Hải Phòng, Quảng Ninh.
Sau khi hợp thức được việc mua bán quặng Titan, Lê Văn Chiến hợp tác với “nhà môi giới” vận tải biển Nguyễn Đức Hùng để nhờ tìm tàu vận chuyển quặng. Khi bị kiểm tra bất chợt, tàu chở quặng của Chiến và Hùng sẽ xuất trình giấy tờ vận chuyển quặng nội địa nhằm đối phó với lực lượng chức năng. Cho đến khi sự việc bị lộ tẩy, Lê Văn Chiến và đồng đã buôn bán trót lọt 28 chuyến, với tổng số trên 75.000 tấn Titan. Vị cựu cán bộ hải quan khai nhận, thông qua mối quan hệ xã hội nên được một số người Trung Quốc “nhờ” đứng ra làm các thủ tục mua bán, vận chuyển quặng Titan trong nội địa Việt Nam để qua mắt lực lượng chức năng rồi tuồn qua Trung Quốc. Mỗi chuyến vận chuyển trót lọt, Chiến được đối tác trả công 30 triệu đồng.
