Sau khi nhận được thông tin, Cục trưởng Cục hàng hải Việt Nam Nguyễn Nhật đã ra lệnh cho tàu SAR27-01 và Cano cao tốc CN01-TSA, CN02-TSA thuộc Trung tâm phối hợp TKCN Hàng hải Việt Nam đang thường trực tại cầu cảng Nha Trang ra hiện trường cứu nạn. Đến 3h40, tàu SAR27-01 đã cứu được 3 thuyền viên của tàu Phúc Xuân 68 đang trôi dạt trên biển. Đến chiều 9-11, ông Nguyễn Nhật cho biết, hiện vẫn còn 8 thuyền viên của tàu Phúc Xuân 68 bị mất tích, lực lượng chức năng đã họp bàn, lên phương án tìm kiếm các thuyền viên còn lại.