Theo đó, khi thực hiện đấu thầu qua mạng, nhà thầu sẽ được miễn phí: truy cập, đọc, xem tất cả các thông tin; đăng tải thông báo mời thầu, mời chào hàng, biên bản mở thầu, kết quả lựa chọn nhà thầu và các thông tin khác trên hệ thống mạng đấu thầu quốc gia; Bên mời thầu được miễn chi phí khi phát hành hồ sơ mời thầu, hồ sơ đề xuất và mở thầu; nhà thầu được miễn chi phí khi tải hồ sơ mời thầu, hồ sơ đề xuất từ hệ thống mạng đấu thầu quốc gia.
Các nội dung chịu chi phí trong đấu thầu qua mạng bao gồm: Chi phí đăng ký tham gia hệ thống mạng đấu thầu quốc gia; Chi phí nộp hồ sơ dự thầu, hồ sơ đề xuất; Chi phí trúng thầu.