Các bị can bị đề nghị truy tố gồm Trần Hải Sơn (SN 1960), nguyên Tổng Giám đốc; Trần Văn Quang (SN 1976), nguyên Trưởng Phòng kế hoạch Công ty Sửa chữa tàu biển Vianlines; Trần Bá Hùng (SN 1979), nguyên cán bộ Công ty Huyndai Vinashin, và Phạm Bá Giáp (SN 1972), nguyên Giám đốc Công ty TNHH Thiên Ân.
Năm 2007, Chủ tịch HĐQT Tổng Công ty Vinalines phê chuẩn dự án mua ụ nổi 83M thuộc dự án Nhà máy sửa chữa tàu biển Vinalines phía Nam (tại tỉnh Bà Rịa – Vũng Tàu) với tổng mức đầu tư hơn 14,1 triệu USD. Quá trình triển khai, Chủ tịch HĐQT, Tổng Giám đốc Vinalines đã chi 9 triệu USD để nhập mua ụ nổi 83M đã cũ, hư hỏng nặng và phải thuê nhà máy Huyndai Vinashin cùng một số đơn vị sửa chữa và đã thanh toán hết 6,1 triệu USD.
Tuy nhiên sau khi đã được “đổ” khá nhiều tiền, ụ nổi 83M vẫn còn nhiều hạng mục cần phải sửa. Đến khi thực hiện nghiệm thu, thanh toán, Trần Văn Quang và các bị can liên quan đã thông qua pháp nhân của Công ty Thiên Ân để gửi giá, lập khống khối lượng… qua đó rút, chiếm hưởng hơn 3,3 tỷ đồng. Trong đó, Trần Hải Sơn chiếm hưởng 2,2 tỷ đồng; Trần Văn Quang chiếm hưởng 453 triệu đồng; Trần Bá Hùng chiếm hưởng 395 triệu đồng, còn Phạm Bá Giáp chiếm hưởng 178 triệu đồng.
Liên quan đến vụ án này, CQĐT Bộ Công an đã khởi tố vụ án về 2 tội danh tham ô tài sản và cố ý làm trái các quy định của Nhà nước về quản lý kinh tế gây hậu quả nghiêm trọng. Theo đó, có 13 đối tượng đã bị khởi tố, trong đó có ông Dương Chí Dũng, nguyên Chủ tịch HĐQT Vinalines bị khởi tố về hành vi cố ý làm trái. Được biết, CQĐT quyết định tách hành vi “cố ý làm trái” của các bị can để xử lý trong một vụ án riêng.
