Trong mùa này, Rooney đã có những màn trình diễn rất ấn tượng, trong đó có nhiều trận anh thi đấu ở vị trí tiền vệ hộ công, chứ không phải vị trí tiền đạo quen thuộc. Hồi đầu mùa, Rooney cũng từng nghỉ thi đấu 4 tuần do bị chấn thương nghiêm trọng ở bắp đùi.
Trở lại sau chấn thương, chân sút MU đã tỏa sáng cùng người đồng đội Van Pesie khi liên tục lập công ở những vòng đấu gần đây. Nhưng thật đen đủi cho Rooney khi anh lại vừa dính chấn thương dây chằng đầu gối trong khi luyện tập.
Phát biểu với báo chí trước thềm trận đấu với Newcastle, Sir Alex Ferguson cho biết: “Sau trận đấu hôm Chủ nhật, tôi nghĩ anh ấy sẽ có động lực mạnh mẽ để chơi tốt trong ngày hôm nay. Không may mắn là anh ấy bị chấn thương và chúng tôi không thể mạo hiểm sử dụng anh ấy. Rooney bị đau sau khi thực hiện một cú volley vào cuối buổi tập. Anh ấy bị đau dây chằng đầu gối và có thể phải nghỉ 2 tới 3 tuần”.
Với chấn thương mới này, Rooney sẽ không có mặt trong các trận gặp West Brom và Wigan tại giải Ngoại hạng, trận đấu với West Ham tại vòng 3 cúp FA vào ngày 5-1-2013.
