Đoàn kiểm tra liên ngành gồm đại diện Tổng cục Thủy sản, Hội Nghề cá Việt Nam, Vụ Nuôi trồng thủy sản và Vasep. Theo đó, nhiệm vụ của đoàn là làm rõ việc vay vốn của các hộ dân, doanh nghiệp nuôi và chế biến cá tra từ các ngân hàng thương mại nhà nước năm 2012, làm rõ nguyên nhân và đề xuất giải pháp để báo cáo Thủ tướng Chính phủ.
Trước đó, Ngân hàng Nhà nước báo cáo, 9 tháng đầu năm 2012 đã cho ngành cá tra vay 38.000 tỷ đồng để đầu tư, vượt qua khó khăn khủng hoảng. Song theo Vasep và Bộ NN&PTNT, con số cho ngành cá tra vay không đến 38.000 tỷ đồng. Bên cạnh đó, con số cho vay phản ánh từ các địa phương cũng thấp hơn rất nhiều con số mà ngân hàng Nhà nước công bố.