Đề án đặt ra mục tiêu tái cơ cấu thị trường vận tải đến năm 2016 trên các hành lang chính và hai trung tâm vận tải trọng điểm, khuyến khích vận tải đường sắt và đường thủy khối lượng lớn, giảm sự phụ thuộc vào vận tải đường bộ đang quá lớn hiện nay. Tại Hà Nội và TP.HCM tăng tỷ lệ đảm nhận của vận tải công cộng. Ba nhóm giải pháp chính sẽ được triển khai gồm: Hoàn thiện hệ thống văn bản quy phạm pháp luật, quy hoạch; Tổ chức và quản lý vận tải; Tăng cường năng lực kết nối tại các công trình kết cấu hạ tầng đầu mối vận tải.
