Bệnh viện được thiết kế với khu khám bệnh gồm 10 phòng, khu cận lâm sàng (X-Quang, xét nghiệm, siêu âm, điện tim…), khu cấp cứu, khu can thiệp tim mạch. Khu phẫu thuật với 2 phòng mổ tim, khu điều trị nội với hơn 30 phòng, khu điều trị ngoại với 15 phòng chăm sóc bệnh nhân sau phẫu thuật. Khu điều trị theo yêu cầu với 7 phòng điều trị tiện nghi, hiện đại… Bệnh viện cũng quy tụ được một tập thể các giáo sư, tiến sỹ, thầy thuốc Nhân dân, thầy thuốc ưu tú cùng các chuyên gia đầu ngành trong lĩnh vực tim mạch về cộng tác làm việc.
Bà Đỗ Thị Thúy Kiều - Chủ tịch HĐQT bệnh viện Tim Đông Đô cho biết: “Bệnh viện nhận được sự đỡ đầu trực tiếp của 2 bệnh viện chuyên ngành là Viện Tim mạch Trung ương và bệnh viện Tim Hà Nội. Cùng với đó, bệnh viện cũng được Bảo hiểm y tế Việt Nam cho phép thực hiện bảo hiểm y tế cho người khám chữa tại bệnh viện từ 1-1-2012”.
