Để thực hiện mục tiêu này, Bộ GD-ĐT được Thủ tướng Chính phủ giao nhiệm vụ chủ trì phối hợp với các bộ, ngành liên quan xây dựng dự toán với kinh phí 20 triệu USD để hỗ trợ cải thiện, nâng cao điều kiện dạy và học của trường chuyên ở các vùng khó khăn. Đây là kinh phí thuộc Chương trình phát triển giáo dục trung học phổ thông, vốn vay của Ngân hàng Phát triển châu Á.